Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms