Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msi1Q61474 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms