Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms