Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd2Q61285 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms