Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sim2Q61079 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms