Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Scarb1Q61009 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Scarb1Q61009 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scarb1Q61009 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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