Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf3Q60765 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atf3Q60765 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf3Q60765 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf3Q60765 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atf3Q60765 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms