Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms