Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcf4Q60722 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms