Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms