Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HnrnpdQ60668 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HnrnpdQ60668 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms