Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Trim38Q5SZ99 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim38Q5SZ99 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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