Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms