Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms