Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms