Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf12Q5SPL2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms