Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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