Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc8bQ5DU41 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms