Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms