Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf354cQ571J5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354cQ571J5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms