Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms