Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms