Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms