Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca4bQ3UW98 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms