Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms