Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6899Q3USS0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms