Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp560Q3URI6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms