Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp953Q3UPV7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp953Q3UPV7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms