Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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