Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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