Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp30Q3UN04 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp30Q3UN04 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms