Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms