Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms