Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcgf5Q3UK78 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms