Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp19Q3UJD6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp19Q3UJD6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp19Q3UJD6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Usp19Q3UJD6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Usp19Q3UJD6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Usp19Q3UJD6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Usp19Q3UJD6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Usp19Q3UJD6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Usp19Q3UJD6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp19Q3UJD6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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