Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccser2Q3UHI0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser2Q3UHI0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms