Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garem1Q3UFT3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms