Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam35aQ3UEN2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam35aQ3UEN2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam35aQ3UEN2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam35aQ3UEN2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam35aQ3UEN2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam35aQ3UEN2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms