Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms