Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem35bQ3U0Y2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms