Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms