Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc28Q3TX51 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms