Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms