Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms