Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc10Q3TLI0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc10Q3TLI0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms