Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms