Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim71Q1PSW8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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