Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd300lgQ1ERP8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms