Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap25Q1EHW4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms