Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli2Q0VGT2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Gli2Q0VGT2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms